Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim24Q64127 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms