Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ift52Q62559 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms