Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms