Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms