Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mkrn3Q60764 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms