Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms