Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms