Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms