Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sfmbt2Q5DTW2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms