Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eme2Q56A04 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eme2Q56A04 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms