Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Samd5Q3V1H9 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms