Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ncbp1Q3UYV9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ncbp1Q3UYV9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms