Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Usp19Q3UJD6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms