Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms