Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Parp8Q3UD82 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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