Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms