Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q3U595 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Q3U595 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q3U595 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q3U595 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q3U595 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Q3U595 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Q3U595 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Q3U595 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q3U595 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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