Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms