Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Map9Q3TRR0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Map9Q3TRR0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms