Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax1Q2NKI2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms