Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nlrp1aQ2LKU9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms