Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms