Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spata18Q0P557 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms