Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp2Q06649 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sh3bp2Q06649 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bp2Q06649 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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