Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms