Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr5Q04683 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr5Q04683 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms