Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GscQ02591 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
GscQ02591 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms