Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms