Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mc1rQ01727 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms