Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp1Q01514 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp1Q01514 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms