Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GabpaQ00422 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GabpaQ00422 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GabpaQ00422 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GabpaQ00422 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms