Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms