Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch1P62046 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch1P62046 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms