Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms