Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SftpdP50404 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms