Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprmP28828 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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