Protein–RNA interactions for Protein: P28662

Bri3, Brain protein I3, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3P28662 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Bri3P28662 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms