Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psmb9P28076 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms