Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
U2af2P26369 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms