Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnnc1P19123 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms