Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl9P18340 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl9P18340 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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