Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PcnaP17918 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms