Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms