Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fgf4P11403 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms