Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxd3P09027 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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