Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChkaO54804 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChkaO54804 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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