Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DffaO54786 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DffaO54786 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DffaO54786 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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