Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Degs1O09005 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms