Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm5849J3QPE5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm5849J3QPE5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm5849J3QPE5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm5849J3QPE5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm5849J3QPE5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms