Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2035J3QP87 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm2035J3QP87 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms